単一の血液培養で腸球菌が検出された状況では，敗血症の臨床的証拠がない場合や，多菌種感染症でより毒性の高い微生物を狙った抗菌薬治療で改善している患者の場合には，腸球菌菌血症に対する治療は延期してもよい．(Rev Infect Dis.1989;11:74. Rev Infect Dis.1991;13:600.)

血管内カテーテルが菌血症の原因である可能性が高い状況では，カテーテルの除去だけで感染を治すことができる．ただし，発熱がある場合は，腸球菌の検出後，追加の血液培養を行い結果を待つ間，経験的に抗菌薬投与を開始する必要がある．このような治療は，症状が軽快し弁の異常が見られない（IE所見がない）場合，通常5〜7日後に中止できる．
E.facalis以外の腸球菌性細菌血症のほとんどの症例は心内膜炎とは関連しない．E.facalis菌血症の患者における心内膜炎の相対リスクは高いが，それでも比較的低い．(Infection.2004;32:72.)